UU Innovation

Globalt samarbete för utveckling av vetenskapliga programvaror

2014-06-24

Uppsala universitet är en av grundarna till en ny arbetsgrupp med målet att skapa långsiktigt hållbar utveckling av programvara för vetenskapliga applikationer. Arbetsgruppen är ett globalt samarbete mellan industri och akademi och bygger på öppen källkod (open source) och ligger inom Eclipse Foundation som är en ideell förening med över 200 medlemmar.

Bland medlemmarna i Eclipse Foundation finns flera multinationella företag och välrenommerade universitet. Mest känt är projektet Eclipse, som är en generell plattform för mjukvaruutveckling.

- Eclipse är basen i den grafiska plattformen Bioclipse som vi utvecklat under de senaste sju åren i Uppsala. Plattformen är helt komponentbaserad och vi kommer att bidra till arbetsgruppen med komponenter inom bioinformatik och läkemedelsutveckling, säger Ola Spjuth, docent i bioinformatik på institutionen för farmaceutisk biovetenskap vid Uppsala universitet.

Ett av målen för arbetsgruppen är att standardisera och samarbeta så att programvarukomponenter kan återanvändas i olika applikationer.

- Ett exempel på en generell komponent är att plotta information i 2D och 3D, det återkommer i de flesta vetenskapliga applikationer vare sig man sysslar med forskning inom högenergifysik, kemi eller biologi, men även system för modellering och simulering, säger Ola Spjuth.

- Att skapa effektivare mjukvaruutveckling blir allt viktigare inom forskning och utveckling och vi är glada över att ha Uppsala universitet som grundande partner för Eclipse Science Working Goup. Uppsala universitet har genom projektet Bioclipse mångårig erfarenhet av bioinformatisk utveckling som kommer att vara värdefull. Tillsammans med andra välrenommerade medlemmar har Eclipse Science Working Goup fått en bra start för att skapa en community för vetenskaplig mjukvaruutveckling, säger Mike Milinkovich, executive director för Eclipse Foundation.


Läs mer:

Press release from Eclipse Foundation 

Eclipse Science Working Group

Bioclipse